Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF5Q969M3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF5Q969M3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF5Q969M3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms