Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCEAL3Q969E4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCEAL3Q969E4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCEAL3Q969E4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCEAL3Q969E4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms