Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDAQ92838 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EDAQ92838 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
EDAQ92838 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDAQ92838 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDAQ92838 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDAQ92838 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDAQ92838 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDAQ92838 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDAQ92838 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDAQ92838 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDAQ92838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDAQ92838 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDAQ92838 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDAQ92838 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDAQ92838 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EDAQ92838 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDAQ92838 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDAQ92838 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDAQ92838 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDAQ92838 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDAQ92838 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDAQ92838 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDAQ92838 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDAQ92838 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EDAQ92838 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDAQ92838 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDAQ92838 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDAQ92838 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDAQ92838 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDAQ92838 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDAQ92838 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDAQ92838 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDAQ92838 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDAQ92838 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDAQ92838 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EDAQ92838 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EDAQ92838 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDAQ92838 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDAQ92838 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDAQ92838 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDAQ92838 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDAQ92838 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDAQ92838 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDAQ92838 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDAQ92838 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDAQ92838 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EDAQ92838 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDAQ92838 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDAQ92838 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDAQ92838 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDAQ92838 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDAQ92838 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EDAQ92838 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDAQ92838 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDAQ92838 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDAQ92838 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EDAQ92838 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms