Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3AQ92664 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3AQ92664 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3AQ92664 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms