Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A3Q92570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A3Q92570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A3Q92570 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A3Q92570 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms