Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3BQ92485 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPDL3BQ92485 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms