Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATAD2BQ8WXI9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GATAD2BQ8WXI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms