Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR60Q8WVS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR60Q8WVS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WDR60Q8WVS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms