Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMBR1Q8WVP7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBR1Q8WVP7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBR1Q8WVP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMBR1Q8WVP7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms