Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC7Q8WUI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC7Q8WUI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC7Q8WUI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HDAC7Q8WUI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms