Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNPDA2Q8TDQ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPDA2Q8TDQ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNPDA2Q8TDQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPDA2Q8TDQ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms