Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF398Q8TD17 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF398Q8TD17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF398Q8TD17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
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