Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GADD45GIP1Q8TAE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GADD45GIP1Q8TAE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GADD45GIP1Q8TAE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1Q8TAE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms