Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT1Q8NF37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT1Q8NF37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT1Q8NF37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LPCAT1Q8NF37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms