Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCPH1Q8NEM0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCPH1Q8NEM0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCPH1Q8NEM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCPH1Q8NEM0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms