Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC1AQ8NC01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC1AQ8NC01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC1AQ8NC01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC1AQ8NC01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms