Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L2Q8NAA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG16L2Q8NAA4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L2Q8NAA4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L2Q8NAA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms