Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKAIN3Q8N8D7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKAIN3Q8N8D7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKAIN3Q8N8D7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKAIN3Q8N8D7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms