Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIRREL3Q8IZU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KIRREL3Q8IZU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIRREL3Q8IZU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIRREL3Q8IZU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms