Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD4Q8IYR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD4Q8IYR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD4Q8IYR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD4Q8IYR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD4Q8IYR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms