Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD2

KLHDC8A, Kelch domain-containing protein 8A, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8AQ8IYD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8AQ8IYD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHDC8AQ8IYD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC8AQ8IYD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC8AQ8IYD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms