Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXR5

FAM178B, Protein FAM178B, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM178BQ8IXR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FAM178BQ8IXR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM178BQ8IXR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM178BQ8IXR5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM178BQ8IXR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM178BQ8IXR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM178BQ8IXR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM178BQ8IXR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM178BQ8IXR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms