Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 325.68■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 30.4
PHF6Q8IWS0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.474e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.66■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 220.42■□□□□ 0.863e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.663e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ESYT2-205ENST00000497111 663 ntTSL 417.02■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 315.65■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 29.24□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 39.2□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 34.6□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.723e-9■■■■■ 30.3
PHF6Q8IWS0 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 231.8■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 30.2
PHF6Q8IWS0 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 321.57■■□□□ 1.043e-7■■■■■ 30.2
PHF6Q8IWS0 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 317.2■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 30.2
PHF6Q8IWS0 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 317.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 CNOT6L-206ENST00000512485 1890 ntTSL 55.83□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 CNOT6L-207ENST00000515441 572 ntTSL 418.43■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 CNOT6L-204ENST00000506166 781 ntTSL 212.71□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 CNOT6L-202ENST00000504804 1925 ntTSL 56.38□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.83e-7■■■■■ 30.1
PHF6Q8IWS0 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 30
PHF6Q8IWS0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 324.47■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 424.47■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 321.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 520.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 29.9
PHF6Q8IWS0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.81e-7■■■■■ 29.8
PHF6Q8IWS0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 29.8
PHF6Q8IWS0 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 513.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 29.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 322.6■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 29.6
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 524.52■■□□□ 1.524e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 223.93■■□□□ 1.424e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 423.46■■□□□ 1.354e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-217ENST00000544309 581 ntTSL 321.25■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.954e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 319.99■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 517.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 317■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-207ENST00000466716 640 ntTSL 516.51■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 216.46■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 414.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-209ENST00000491310 525 ntTSL 514.27□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 313.46□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 29.3
PHF6Q8IWS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.199e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 320.55■□□□□ 0.889e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 319.08■□□□□ 0.649e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 219.07■□□□□ 0.649e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.2■□□□□ 0.189e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.029e-9■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 29.2
PHF6Q8IWS0 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 414.62□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 29.1
PHF6Q8IWS0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 29.1
PHF6Q8IWS0 BBC3-205ENST00000598636 900 ntTSL 226.21■■□□□ 1.797e-8■■■■■ 29.1
PHF6Q8IWS0 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.41□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 29.1
PHF6Q8IWS0 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 226.83■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 28.9
PHF6Q8IWS0 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 225.86■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 28.9
PHF6Q8IWS0 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 527.57■■■□□ 27e-7■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.287e-7■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 528.22■■■□□ 2.113e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 528.05■■■□□ 2.083e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 327.99■■■□□ 2.073e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 527.11■■□□□ 1.933e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-210ENST00000450533 2451 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 516.04■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 4,170 protein–RNA pairs in 79.1 ms