Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC83Q8IWF9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC83Q8IWF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC83Q8IWF9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC83Q8IWF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms