Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD3Q8IVD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUDCD3Q8IVD9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDCD3Q8IVD9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms