Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLD3Q8IV08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLD3Q8IV08 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLD3Q8IV08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLD3Q8IV08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms