Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRAG1Q86YV5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRAG1Q86YV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRAG1Q86YV5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRAG1Q86YV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRAG1Q86YV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms