Protein–RNA interactions for Protein: Q86X10

RALGAPB, Ral GTPase-activating protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPBQ86X10 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RALGAPBQ86X10 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RALGAPBQ86X10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
RALGAPBQ86X10 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RALGAPBQ86X10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RALGAPBQ86X10 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RALGAPBQ86X10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RALGAPBQ86X10 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms