Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RASSF3Q86WH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RASSF3Q86WH2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RASSF3Q86WH2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF3Q86WH2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF3Q86WH2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms