Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD163Q86VB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD163Q86VB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD163Q86VB7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms