Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHFPL3Q86UP9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL3Q86UP9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL3Q86UP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms