Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINA11Q86U17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA11Q86U17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINA11Q86U17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA11Q86U17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms