Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDDC2Q7Z4H3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HDDC2Q7Z4H3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDDC2Q7Z4H3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms