Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RUFY3Q7L099 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RUFY3Q7L099 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RUFY3Q7L099 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RUFY3Q7L099 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RUFY3Q7L099 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms