Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED13LQ71F56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED13LQ71F56 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MED13LQ71F56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13LQ71F56 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED13LQ71F56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED13LQ71F56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED13LQ71F56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED13LQ71F56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED13LQ71F56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms