Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL4Q6ZR62 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTL4Q6ZR62 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms