Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRBA2Q6ZNG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRBA2Q6ZNG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRBA2Q6ZNG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA2Q6ZNG9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA2Q6ZNG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRBA2Q6ZNG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRBA2Q6ZNG9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms