Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM72Q6ZMU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM72Q6ZMU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM72Q6ZMU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM72Q6ZMU5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM72Q6ZMU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 845.4 ms