Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THSD4Q6ZMP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THSD4Q6ZMP0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD4Q6ZMP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD4Q6ZMP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms