Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TPTE2Q6XPS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPTE2Q6XPS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TPTE2Q6XPS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPTE2Q6XPS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TPTE2Q6XPS3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TPTE2Q6XPS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TPTE2Q6XPS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms