Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPESP1Q6UW49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPESP1Q6UW49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPESP1Q6UW49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPESP1Q6UW49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPESP1Q6UW49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms