Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL17Q6TDP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL17Q6TDP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL17Q6TDP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms