Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZBED9Q6R2W3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ZBED9Q6R2W3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZBED9Q6R2W3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZBED9Q6R2W3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ZBED9Q6R2W3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
ZBED9Q6R2W3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBED9Q6R2W3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms