Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q6Q795 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6Q795 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q6Q795 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6Q795 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6Q795 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6Q795 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6Q795 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q6Q795 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6Q795 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6Q795 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6Q795 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6Q795 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6Q795 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6Q795 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6Q795 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6Q795 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6Q795 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6Q795 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6Q795 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6Q795 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6Q795 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6Q795 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q6Q795 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6Q795 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6Q795 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q6Q795 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q6Q795 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q6Q795 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q6Q795 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6Q795 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6Q795 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6Q795 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q6Q795 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6Q795 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6Q795 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6Q795 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6Q795 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q6Q795 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6Q795 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6Q795 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6Q795 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6Q795 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q6Q795 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q6Q795 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q6Q795 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q6Q795 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms