Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LLGL2Q6P1M3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LLGL2Q6P1M3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LLGL2Q6P1M3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LLGL2Q6P1M3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms