Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHLDB3Q6NSJ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHLDB3Q6NSJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHLDB3Q6NSJ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDB3Q6NSJ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms