Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1LQ69YQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1LQ69YQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPECC1LQ69YQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPECC1LQ69YQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPECC1LQ69YQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPECC1LQ69YQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms