Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM236Q5W0B7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM236Q5W0B7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms