Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARMC3Q5W041 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARMC3Q5W041 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARMC3Q5W041 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARMC3Q5W041 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms