Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
ECM29Q5VYK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ECM29Q5VYK3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ECM29Q5VYK3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ECM29Q5VYK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms